Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2A1P52655 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms