Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KPNA1P52294 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KPNA1P52294 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA1P52294 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA1P52294 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KPNA1P52294 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms