Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRE11P49959 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRE11P49959 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRE11P49959 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRE11P49959 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRE11P49959 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRE11P49959 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRE11P49959 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRE11P49959 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRE11P49959 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRE11P49959 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms