Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF6P49848 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF6P49848 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF6P49848 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF6P49848 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF6P49848 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF6P49848 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF6P49848 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF6P49848 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF6P49848 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF6P49848 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF6P49848 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF6P49848 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF6P49848 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF6P49848 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF6P49848 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF6P49848 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF6P49848 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms