Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RARRES1P49788 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms