Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUMBP49757 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUMBP49757 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUMBP49757 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUMBP49757 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUMBP49757 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUMBP49757 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUMBP49757 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUMBP49757 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUMBP49757 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUMBP49757 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUMBP49757 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUMBP49757 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUMBP49757 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUMBP49757 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUMBP49757 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUMBP49757 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms