Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTAP49354 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTAP49354 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTAP49354 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTAP49354 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FNTAP49354 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FNTAP49354 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTAP49354 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTAP49354 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTAP49354 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTAP49354 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTAP49354 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FNTAP49354 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FNTAP49354 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FNTAP49354 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FNTAP49354 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FNTAP49354 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNTAP49354 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FNTAP49354 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNTAP49354 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms