Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GALR1P47211 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GALR1P47211 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GALR1P47211 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GALR1P47211 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GALR1P47211 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GALR1P47211 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GALR1P47211 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GALR1P47211 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GALR1P47211 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GALR1P47211 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GALR1P47211 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GALR1P47211 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GALR1P47211 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GALR1P47211 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GALR1P47211 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALR1P47211 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALR1P47211 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALR1P47211 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALR1P47211 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GALR1P47211 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms