Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATRXP46100 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATRXP46100 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATRXP46100 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATRXP46100 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATRXP46100 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATRXP46100 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms