Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFMP43652 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AFMP43652 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFMP43652 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFMP43652 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AFMP43652 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFMP43652 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFMP43652 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AFMP43652 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFMP43652 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFMP43652 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFMP43652 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFMP43652 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFMP43652 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFMP43652 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFMP43652 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFMP43652 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms