Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYKP43405 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYKP43405 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYKP43405 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYKP43405 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYKP43405 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYKP43405 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYKP43405 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYKP43405 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYKP43405 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYKP43405 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYKP43405 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYKP43405 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYKP43405 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYKP43405 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYKP43405 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYKP43405 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYKP43405 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYKP43405 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYKP43405 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYKP43405 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYKP43405 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYKP43405 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYKP43405 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYKP43405 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYKP43405 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYKP43405 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms