Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTSOP43234 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTSOP43234 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTSOP43234 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTSOP43234 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTSOP43234 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTSOP43234 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSOP43234 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSOP43234 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSOP43234 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSOP43234 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTSOP43234 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTSOP43234 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms