Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC1A4P43007 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC1A4P43007 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms