Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSG1P42857 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSG1P42857 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSG1P42857 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSG1P42857 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NSG1P42857 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NSG1P42857 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NSG1P42857 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSG1P42857 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSG1P42857 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSG1P42857 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms