Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP2P42575 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP2P42575 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP2P42575 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP2P42575 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP2P42575 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP2P42575 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP2P42575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP2P42575 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP2P42575 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP2P42575 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP2P42575 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP2P42575 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP2P42575 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP2P42575 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP2P42575 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms