Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms