Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PIK3CAP42336 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PIK3CAP42336 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms