Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms