Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTRLP40313 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTRLP40313 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTRLP40313 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTRLP40313 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTRLP40313 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CTRLP40313 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTRLP40313 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTRLP40313 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTRLP40313 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms