Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP12P39900 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP12P39900 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP12P39900 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP12P39900 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP12P39900 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP12P39900 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP12P39900 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP12P39900 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP12P39900 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP12P39900 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP12P39900 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP12P39900 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP12P39900 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP12P39900 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP12P39900 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP12P39900 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms