Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIK1P39086 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIK1P39086 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIK1P39086 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms