Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 STB2YMR053C 2553 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 LEU1YGL009C 2340 nt3.86□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TDA11YHR159W 1515 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 LYS2YBR115C 4179 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 PEX30YLR324W 1572 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 NOC2YOR206W 2133 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TGL4YKR089C 2733 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YDR274CYDR274C 372 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 RPC17YJL011C 486 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 CYC1YJR048W 330 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YKL071WYKL071W 771 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YAL066WYAL066W 309 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 BUD28YLR062C 378 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 CSM3YMR048W 954 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 HFA1YMR207C 6372 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 CUE5YOR042W 1236 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 SER1YOR184W 1188 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TOM5YPR133W-A 153 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YCL041CYCL041C 495 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 DIP2YLR129W 2832 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 SKM1YOL113W 1968 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 Q0255Q0255 1419 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 TRM13YOL125W 1431 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 HOS3YPL116W 2094 nt3.85□□□□□ -1.79
AVT5P38176 NHX1YDR456W 1902 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 BUD30YDL151C 582 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 RNH202YDR279W 1053 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 GIC2YDR309C 1152 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YFL064CYFL064C 525 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YGL199CYGL199C 471 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ERG20YJL167W 1059 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YJR096WYJR096W 849 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 SIC1YLR079W 855 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 ATP14YLR295C 375 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLR462WYLR462W 609 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YPR202WYPR202W 717 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.84□□□□□ -1.79
AVT5P38176 CDC14YFR028C 1656 nt3.84□□□□□ -1.8
AVT5P38176 SMF1YOL122C 1728 nt3.84□□□□□ -1.8
AVT5P38176 IME4YGL192W 1803 nt3.84□□□□□ -1.8
AVT5P38176 NNK1YKL171W 2787 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 AIM6YDL237W 1173 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 HIM1YDR317W 1245 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 RPB7YDR404C 516 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 LPP1YDR503C 825 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 SUT1YGL162W 900 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 RPL8AYHL033C 771 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 GAT4YIR013C 366 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 RPL43BYJR094W-A 279 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 PCD1YLR151C 1023 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 RAD10YML095C 633 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YBL077WYBL077W 432 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 CPR8YNR028W 927 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 GLO4YOR040W 858 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 TAF3YPL011C 1062 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 TIF5YPR041W 1218 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 BUD8YLR353W 1812 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 SUL2YLR092W 2682 nt3.83□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YSH1YLR277C 2340 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 RAD28YDR030C 1521 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 TFA1YKL028W 1449 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 ENT1YDL161W 1365 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 FBP26YJL155C 1359 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 PER1YCR044C 1074 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YDR290WYDR290W 330 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 ATP5YDR298C 639 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 ATP6Q0085 780 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 DDI2YFL061W 678 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YGL193CYGL193C 312 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 VMA22YHR060W 546 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 MAP1YLR244C 1164 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 PRE7YBL041W 726 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 RUF20RUF20 443 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 DDI3YNL335W 678 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 MRPL37YBR268W 318 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 VMA1YDL185W 3216 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 ECM22YLR228C 2445 nt3.82□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YCR023CYCR023C 1836 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 MDM30YLR368W 1797 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 NGL3YML118W 1518 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 HRR25YPL204W 1485 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 PUT1YLR142W 1431 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 COT1YOR316C 1320 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 COQ4YDR204W 1008 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YEA4YEL004W 1029 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 NOP16YER002W 696 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 PEX14YGL153W 1026 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YGR219WYGR219W 342 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YGR269WYGR269W 327 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 SFH5YJL145W 885 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 FBP1YLR377C 1047 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 FAR3YMR052W 615 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YNR061CYNR061C 660 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 YPL199CYPL199C 723 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 MIS1YBR084W 2928 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 IKS1YJL057C 2004 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 NPL4YBR170C 1743 nt3.81□□□□□ -1.8
AVT5P38176 SUP35YDR172W 2058 nt3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29 ms