Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT2P35908 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT2P35908 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT2P35908 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT2P35908 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT2P35908 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT2P35908 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT2P35908 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT2P35908 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT2P35908 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms