Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH11P35749 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYH11P35749 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYH11P35749 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYH11P35749 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYH11P35749 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYH11P35749 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYH11P35749 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYH11P35749 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYH11P35749 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYH11P35749 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYH11P35749 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYH11P35749 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYH11P35749 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYH11P35749 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYH11P35749 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms