Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYLC1P35663 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLC1P35663 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms