Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT9P35527 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT9P35527 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT9P35527 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT9P35527 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT9P35527 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT9P35527 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT9P35527 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT9P35527 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT9P35527 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT9P35527 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT9P35527 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms