Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR1P32246 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR1P32246 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR1P32246 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCR1P32246 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCR1P32246 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCR1P32246 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR1P32246 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR1P32246 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms