Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRIP30626 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRIP30626 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRIP30626 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRIP30626 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRIP30626 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRIP30626 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRIP30626 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRIP30626 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRIP30626 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms