Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIPP30301 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MIPP30301 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MIPP30301 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MIPP30301 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MIPP30301 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MIPP30301 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MIPP30301 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPP30301 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPP30301 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPP30301 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPP30301 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPP30301 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MIPP30301 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms