Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINB3P29508 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINB3P29508 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms