Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHA3P29320 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms