Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRMP28827 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTPRMP28827 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
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