Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-DMAP28067 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HLA-DMAP28067 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms