Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNCP24863 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNCP24863 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNCP24863 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNCP24863 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNCP24863 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNCP24863 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNCP24863 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNCP24863 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCNCP24863 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCNCP24863 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 449.8 ms