Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR2F2P24468 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR2F2P24468 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms