Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGA6P23229 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA6P23229 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA6P23229 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms