Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX1P22670 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX1P22670 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFX1P22670 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFX1P22670 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFX1P22670 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX1P22670 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX1P22670 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX1P22670 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RFX1P22670 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RFX1P22670 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RFX1P22670 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RFX1P22670 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms