Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB5AP20339 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB5AP20339 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms