Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCNA2P20248 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNA2P20248 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms