Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A1P19634 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A1P19634 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms