Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XBP1P17861 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XBP1P17861 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XBP1P17861 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XBP1P17861 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XBP1P17861 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XBP1P17861 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XBP1P17861 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XBP1P17861 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XBP1P17861 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XBP1P17861 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XBP1P17861 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms