Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRNB2P17787 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms