Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF7P17544 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF7P17544 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF7P17544 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF7P17544 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF7P17544 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF7P17544 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF7P17544 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF7P17544 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF7P17544 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF7P17544 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms