Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACADSP16219 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADSP16219 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADSP16219 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSP16219 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSP16219 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSP16219 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSP16219 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSP16219 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSP16219 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSP16219 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSP16219 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSP16219 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSP16219 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSP16219 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSP16219 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSP16219 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACADSP16219 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms