Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ITGB4P16144 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGB4P16144 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGB4P16144 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms