Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP2P16035 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMP2P16035 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms