Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA1P15976 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms