Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPA2P15927 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPA2P15927 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA2P15927 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA2P15927 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPA2P15927 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPA2P15927 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPA2P15927 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPA2P15927 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPA2P15927 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPA2P15927 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms