Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC130P13994 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC130P13994 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms