Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPB41P11171 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPB41P11171 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPB41P11171 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPB41P11171 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPB41P11171 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPB41P11171 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPB41P11171 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPB41P11171 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPB41P11171 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPB41P11171 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms